锦衣卫镇抚大人鹤川接到一桩诡异的案子，几番追查发现案子牵连甚广，甚至威胁到大唐和神秘苗疆的交好，失踪的苗疆圣女、神秘的青衣女子、野心勃勃的大理寺少卿舟行等。到底谁才是幕后黑手？

《少年锦衣卫 第一季》为第00集至第13集，第一季首集《00 序章》为2016年12月29日上线。《少年锦衣卫 第二季》为第14集至第27集，第二季首集《14 序章》为2017年9月28日上线。大明初起，明太祖朱元璋设锦衣卫亲军指挥使司，后分设南北镇抚司，稽查百官，权势煊赫。锦衣卫沿袭百年，南北镇抚司势如水火，相争不下。朝堂党争激烈，江湖盗匪猖獗，盛世繁华之下，却隐藏着汹涌暗流……

明天启七年，北镇抚司锦衣卫沈炼在一次扫除乱党任务中，为救画师北斋，将同僚凌云铠灭口。此后一方面要摆脱来自陆文昭、裴纶的质疑与调查，一方面又在神秘女子的要挟下放火烧了锦衣卫经历司。裹挟在乱世，沈炼与北斋情陷其中，却越陷越深。而在这一切的背后，巨大阴谋正暗中布局。众生如蝼蚁囿于修罗场，逆鳞之战，一触即发……