故事发生在遥远的二零二零年，在同神秘生物“原肠动物”的战争中，人类首次尝到了彻底失败的滋味，土地被剥夺，权利被压榨，在冷酷的独裁统治之下，人类被迫过起了苟且偷生的压抑生活。然而，即便如此，坚强的人们仍然没有放弃反抗的机会，为了对抗强大的敌人，“天童民间警备公司”成立了。表面看来，里见莲太郎（梶裕贵配音）只是一介平凡的十六岁告众人，可实际上，他年纪轻轻就已经成为了“民警”中的一员，在搭档蓝原延珠（日高里菜配音）的帮助下，莲太郎决定要找到莫名死亡的父母的真正死因。一个绝密任务的出现将莲太郎带往了巨大谜团的中心

麦圈、可可及宠物狗肉丸收到天童寺饭团师叔的飞信传书，天童寺中记载时间万物进化过程、动植物习性的宝书《乾坤宝鉴》被盗。两人一狗为帮助饭团师叔寻回宝鉴，在凤凰山、雅戈尔动物园、天宫庄园植物园等地经历了一系列的冒险，终于成功寻回《乾坤宝鉴》。

麦圈是初中二年级的学生，有小聪明却成绩一直不好。可可是麦圈的堂妹，成绩优秀却有些任性。肉丸是他们家的宠物狗，贪吃可爱却有一股莫名的神奇力量。为了解决作业问题和取得好成绩，麦圈经过肉丸的指点，与可可一起去天童寺拜师学艺。为了能顺利拜师，他们接受了天童寺主持的三个要求，并为此游历了东钱湖、梁祝文化公园、走马塘等宁波大小旅游景点，历经了一段奇异的旅程。在惊险和困难中他们懂得了世上无难事，只怕有心人。